扁平疣的发生与病毒感染有关，因此要尽量避免病毒感染的发生。其具体预防措施如下所述。
1、普及卫生宣传，养成良好的卫生习惯，避免使用患者物品用具，防止间接传染。
2、注意防护，避免外伤及皮肤破损，对皮肤粘膜破损处应妥善处理，防止病毒乘虚而入。远离紫外线、电离辐射，远离创伤性治疗，如电离子、激光、自身疣体埋植治疗。远离激素类药物。此类治疗易形成“同型反应”，导致难以祛除的斑痕，且可加重病情。
3、已发生扁平疣者，不宜搔抓，应及时到专科医院接受治疗，以免自身接种传播。
4、卫生器具要经常消毒，定人定物，防止交叉感染。身体抵抗力低下者，需加强锻练，提高身体素质，增强抗病能力。
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