若作病理检查，光镜下见表皮细胞排列整齐，鳞状上皮呈乳头状增生，棘层细胞增生，有时显空泡形成，细胞变大，胞浆变淡，核大呈嗜碱性。
病灶特征明显，容易确诊。若作病理，光镜下见表皮细胞排列整齐，鳞状上皮呈乳头状增生，棘层细胞增生，有时显空泡形成，细胞变大，胞浆变淡，核大呈嗜碱性。
一般根据赘生物生长部位、临床表现，尖锐湿疣的诊断并不困难，一般与下列疾病鉴别诊断要点：
1、假性湿疣 主要发生在女性小阴唇内侧和阴道前庭，对称分布，一般为白色或者淡红色小丘疹，少数呈息肉状，病理检查可与尖锐湿疣相鉴别。
2、扁平湿疣 属二期梅毒，有时其外形与尖锐湿疣相似，但是梅毒血清实验呈强阳性。
3、生殖器鳞状细胞癌 孕期尖锐湿疣可迅速长大，甚至发生糜烂、渗液，易与鳞状细胞癌混淆。但是后者多见于40岁以上患者，且病损坚硬，易出血，病理检查显示由不同比例的间变鳞状细胞构成。
