卵巢巧克力囊肿也叫子宫内膜异位囊肿，是子宫内膜异位症的一种，是由于子宫内膜异位到卵巢，异位的子宫内膜受性激素的影响，随同月经周期反复脱落出血，使卵巢增大，形成内含陈旧性积血的囊肿，这种陈旧性积血呈褐色，粘稠如糊状，似巧克力，故又称“巧克力囊肿”。这种囊肿可以逐渐增大，有时会在经期或经后发生破裂。
囊肿破裂后流至盆腔内的积血，刺激腹膜，引起剧烈腹痛，并可造成盆腔器官的粘连。卵巢巧克力囊肿可以在没有诱因情况下自发破裂，粗暴或剧烈的性生活，尤其是经前期性生活，常是常见的导致囊肿破裂的重要诱因。
较小的卵巢巧克力囊肿，通常不易发生破裂。卵巢巧克力囊肿的药物治疗效果差，难以消除巧克力囊肿，当囊肿增大到3厘米以上，自发破裂的风险开始出现，并逐渐增加，它长到一定大小，自发破裂常难以避免。因此，它的确是藏在盆腔内的“炸弹”，说不定何时会发生“爆炸”。
巧克力囊肿主要发生在30-40岁之间的中青年妇女。主要是由于月经期子宫壁脱落的子宫内膜碎片因引流不畅，不能全部从阴道排出，有少量经输卵管向盆腔倒流。卵巢巧克力囊肿的病因尚未清楚，环境因素、生活习惯、精神状态等都可能与卵巢囊肿的发病有关系，但与已婚未婚没有什么关系。所以，卵巢囊肿可以发生在任何年龄段，一般高发于20-50岁女性，未婚女性患如发现有月经失调、经量减少甚至腹痛等症状时，应提高警惕，及时检查，特别是身材偏胖的青少年女性更需注意。
