多种抽动综合征的病因、病理目前尚不清楚。有人推测是器质性的病变，主要是基底部神经节的功能障碍，该处为脑内多巴胺含量最高的部位，多巴胺的重要生理功能之一是调节运动功能，有报道多发性抽动症患者脑内儿茶酚胺（包括多巴胺）的更新率加速，也有人认为本病与精神因素、遗传因素关系密切。
从临床观察来看，部分病例是由物理刺激（如结膜炎、落枕、颈部不适、鼻咽炎症）或应激诱发（分离焦虑、转学、遭受训斥、弟妹出生、开始走路等）所致，更多的则是这些因素增加了抽动症发病及加重了病情程度。发育儿科学近年来特别强调母子关系质量与发病之间存在密切关联，诸如母亲过度保护、期望过高、过度干涉等特别容易诱发或加重儿童的抽动症状。相反，理性的关爱、心理的支持、适度地对抽动症状“视而不见”可减轻病情。
