分流性高胆红素血症综合征可引起先天性胆道畸形、中枢神经系统损害及胆红素脑病，具体如下：
1、先天性胆道畸形：先天性胆道闭锁是先天性发育障碍所致的胆道梗阻，是新生儿期长时间梗阻性黄疸的常见原因，病变可累及整个胆道，亦可仅累及肝内或肝外的部分胆管，其中以肝外胆道闭锁常见，占85％~90％，发病率女性高于男性。
2、中枢神经系统损害：中枢系统主要由神经元和神经胶质细胞组成，损伤时既有神经元的病理改变又有神经胶质细胞的病理改变。在中枢神经系统中，各种细胞对损伤的易感性不同，神经元和髓鞘最易受累，其次为少突胶质细胞，再次为星形胶质细胞和小胶质细胞。除基本病理改变外，不同原因造成的损伤还有其特殊表现。
3、胆红素脑病：过去称核黄症。是指高非结合胆红素血症时，游离胆红素通过血脑屏障，沉积于基底神经核、丘脑、丘脑下核、顶核、脑室核、尾状核、以及小脑、延脑、大脑皮质及脊髓等部位，抑制脑组织对氧的利用，导致脑损伤。
