预防肺宫崎肺吸虫症的关键是改变不良饮食习惯，切实做到不生食或半生不熟的蟹、蜊蛄及生水等以预防感染，对流行区的转续寄主（如猪、鸡等）的肉类也应熟食。不随地吐痰，管理好人畜粪便，防止虫卵入水污染水源。宣传教育是预防本病最重要的措施，除积极治疗病人及病畜以消除传染源。
