胆总管结石患者如没有得到及时有效的治疗，很有可能会导致下面的并发症：
1、急性化脓性胆管炎
急性化脓性胆管炎是原发性胆管结石最常见的并发症，又称胆道感染，原发性胆管结石的临床表现大多与它有关。
2、胆源性肝脓肿
胆源性肝脓肿以多发性小脓肿多见。可有右上腹痛，也可能没有腹痛，表现为寒战高热，为弛张热型，黄疸可有可无，病程一般较长。
3、胆道出血
胆道出血是原发性胆管结石的较严重的并发症。
4、胆源性肝硬化
胆源性肝硬化是原发性胆管结石的晚期并发症，属于晚期胆道病。严重时伴有门静脉高压、脾大及脾功能亢进。除有肝胆管结石的症状外，还有肝硬化和门静脉高压的表现。
5、胆管癌
大多数学者认为胆管癌的发生与原发性胆管结石有关。特别是肝内胆管结石并感染者发生肝内胆管癌较多，又称胆管细胞型肝癌。往往被原发性胆管结石的症状所掩盖，术前容易漏诊。
6、胆源性胰腺炎
原发性胆管结石合并急性胰腺炎大大少于继发性胆管结石，可能与原发性胆管结石病人大多存在Oddi括约肌呈松弛状态有关。
