(一)发病原因
暗色丝孢霉病 又称暗色孢子丝菌病 (phaeosporotrichosis)，暗色真菌囊肿(phaeomycotic cyst)，脑着色真菌病(cerebral chromomycosis)等，暗色孢科真菌为条件致病菌，约有30余属50多种，其组织相均为棕色分隔的菌丝，当机体免疫力下降时，空气中孢子和菌丝可通过肺，皮肤伤口或其他途径感染人体，并可经血液循环播散至全身，暗色丝孢霉病较少见，可分为两类：皮下组织暗色丝孢霉病和系统性暗色丝孢霉病，皮下组织暗色丝孢霉病常表现为孤立的皮下或肌肉脓肿 ，也可表现为皮下囊肿，称为暗色真菌囊肿，若血行播散，以肺脏，骨骼，心内膜及脑最易累及，肝，脾，肾等也常受累，出现化脓性肉芽肿样反应伴脓肿形成，多预后不良，一般在发病1年内死亡。
(二)发病机制
本病可由裴氏，紧密，疣 状，皮炎着色真菌及分支孢子菌等引起，国内以卡氏枝孢霉为最多见，其次为裴氏着色菌，紧密着色真菌，甄氏瓶霉等，最近又发现棘状外瓶霉等暗色丝孢霉所引起者，暗色孢科真菌为条件致病菌，约有30余属50多种，其组织相均为棕色分隔的菌丝，在组织或脓液中呈圆形棕黄色真菌细胞，直径6～12μm，并不生芽，在自然界分布很广，多寄生在潮湿的土壤与腐烂的谷草木材中，当机体免疫力下降时，空气中孢子和菌丝可通过肺，皮肤伤口或其他途径感染人体，并可经血液循环播散至全身，偶可侵犯脑组织及其它脏器。
