1、首先应加强护理，注意卫生，给予软嫩而容易消化的饲料，圈舍要暖和而通风，最好在天晴时放牧，让病羊能晒晒太阳。特别是在发疹期，要加强保温。铺上垫草，供给温水。
2、病初可注射免疫血清，1.5千克左右重的羊注射20毫升，体重大者应多加注射，但血清较贵，不太划算，故宜用于贵重的种羊和幼羔。
3、皮下注射0.1％麝香酒精溶液。这是青海牧民的治疗经验，经过兽医诊断实验室试验，证明效果良好。
配制方法：将麝香1克研碎，加无菌蒸馏水1000毫升，为促进溶解，可稍微加温。将此溶液静置1周后再行过滤。滤得的溶液呈棕红色，清朗透明，有特殊气味。亦可将麝香溶于生理盐水或60度的白酒中，浓度同前。
用法：皮下注射1毫升。必要时重复注射1～2次。
病羊（出现丘疹以后）于注射后第4天即见结痂，开始痊愈。严重的于注射后第2天即可恢复食欲及反刍，精神亦见好转。
4、局部治疗
对皮肤上的痘疮，涂以碘酊或紫药水；水泡或脓疱破裂后，应先用3％来苏儿或石炭酸洗涤，然后涂药；对黏膜上的病灶先用0.1％高锰酸钾洗涤后，涂以碘甘油或紫药水。
5、恶性山羊痘，采用“九一四”治疗，剂量为0.01克/千克体重，配成5％的溶液，静脉注射。一般成年羊用0.3克，溶于生理盐水10毫升中即可，平均15～20千克的成年奶羊，用量不得超过0.4～0.5克；5月龄以下的仔山羊不超过0.1～0.15克；5月龄以上的仔羊不超过0.2～0.25克,，注射后有不安、呻吟等中毒现象，但第2天即体温下降，恢复食欲，全身状况好转。早期病羊在注射后1周左右痊愈，脓疱期与水泡期的可以迅速制止其继续发展。
6、中兽医辨证施治。
⑴中兽医认为羊痘是由湿热所引起的一种疫病，是因内伤饮食的脾胃运化失调，而湿热内积。故治疗上应以健脾燥湿、清热解毒、发表和里为总则，重点抓住内清外表这个重要环节，内清五脏六腑之湿，外解肌肉皮毛之毒。采用“葛根汤”：
葛根、紫草、苍术各15克，黄连9克（或黄柏15克），白糖、绿豆各30克煎灌，每日1剂，连服3剂。
根据验证资料，紫草、黄连、黄柏都有抑制病毒的作用（上述湿、热、毒均可理解为病毒）。紫草有效成分为乙酰紫草素，黄连、黄柏均含有小檗碱（即黄连素）。
⑵本着清热解毒，解痉透疹，发汗祛风，散结消肿止痛的原则，应用以下处方：
双花、板蓝根、蝉蜕各12克，连翘、防风、生甘草各9克，煎灌，隔日1次。
7、用蘑菇水治羊痘。方法是：用蘑菇30克、白糖3克，加水500毫升。加温后可灌大羊20只，小羊25只。对恶性羊痘可适当增加用量，灌完后，接着灌些清水，把漏斗冲洗干净，对初发病羊3～5天即愈，恶性羊痘5～7天痊愈。
8、为了防止继发症，或发现有继发感染时，可以使用磺胺类药物或青霉素、四环素等。四环素每次剂量为50万国际单位，溶于糖盐水50毫升内静注，每日1次。
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