慢性肾盂肾炎的主要危害，就是病情在不知不觉中发展，最后造成了慢性肾衰竭。不过，由于现在已有更多的预防性治疗儿童泌尿道感染，所以在今天已很少发生这种情况。 应对措施： 治疗的方式要视发现疾病时，病情已发展到什么阶段而定。虽然医生有时必须对儿童患者动外科手术，将膀胱内发生故障的活瓣机理加以矫治，但是这种外科手术对成人患者却并不一定适用，如果反复感染是由于肾结石等其他原因所造成，只要将这些病因去除，就可以使慢性肾盂肾炎消退。此外，医生可能会给患者服用抗菌药物。
