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健康人的胃肠道内寄居着种类繁多的微生物，这些微生物称为肠道菌群。肠道菌群按一定的比例组合，各菌间互相制约，互相依存，在质和量上形成一种生态平衡，一旦机体内外环境发生变化，特点是长期应用广谱抗生素，敏感肠菌被抑制，未被抑制的细菌而乘机繁殖，从而引起菌群失调，其正常生理组合被破坏，而产生病理性组合，引起临床症状就称为肠道菌群失调症（alterationofintestinaflora）。本症的发生率约为2%～3%。
预防菌群失调症的关键在于合理使用抗生素，避免滥用或长期使用，可用可不用者不用，可用窄谱则不用广谱。对年老体弱、慢性消耗性疾病者，使用抗生素或者激素时，要严格掌握适应症。最好能作药物敏感试验，选择最敏感的抗生素。
在用抗生素的同时，可口服乳酶生和维生素。老幼病后衰弱者，在用抗生素的同时，可口服乳酶生、维生素B族及维生素C等，以防肠道菌群失调。在大手术前，应注意配合全身支持疗法，如给予高营养、服维生素类药物及输血等。
关于正常肠道菌群的恢复，轻型病例停用抗生素后任其自行恢复即可。严重病例可口服乳酸杆菌制剂（如乳酶生、乳酸菌素片）、维生素C及乳糖、蜂蜜、麦芽糖等以扶植大肠杆菌;口服叶酸、复合维生素B、谷氨酸及维生素B12以扶植肠球菌;亦可用健康成人粪滤液保留灌肠，以引入正常菌群。
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