生殖器疱疹在男性可发生在龟头、冠状沟、包皮、阴囊、尿道口等部位；女性发生在外阴、宫颈、肛周、大腿、臀部等部位。
（1）局部症状：发疹初期局部灼热、痒、感觉异常，接着群簇性针头大小的红斑丘疹，继之发展为粟粒及绿豆大小的水疱群，疱壁几近透明，疱浆为淡黄色澄清浆液，疱疹常相互融合、破溃、糜烂，伴疼痛。疱疹在7～11天达高峰，2～4周结痂，愈合。可以遗留暂时性色素沉着，不留瘢痕。泌尿生殖器通道部位疱疹可有排尿困难，尿道或阴道分泌物增多，可伴腹股沟淋巴结肿痛。肛门直肠疱疹者局部疼痛、有里急后重感和便秘。
（2）全身症状：患者中40%男性、70％女性会出现全身症状，主要为神经症状，如感觉异常、神经痛等，常伴发热、头痛、肌痛等。
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