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Cystic fibrosis is usually diagnosed in infancy but occasionally there are those individuals who develop what is called adult onset cystic fibrosis.

心房颤动患者心房组织囊性纤维化跨膜转运调...

目的 探讨心房颤动(简称房颤)患者心房组织囊性纤维化跨膜转运调节体(CFTR)氯通道基因的表达。方法 应用半定量逆转录多聚酶链反应(RT-PCR)比较窦性心律(sR)组(n=31)、阵发性房颤(PAF)组(n=7)和慢性房颤

研究囊性纤维化取得新进展

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美国Luminex公司开发囊性纤维化诊断试剂盒

生物谷一种新型的囊性纤维(CF)测试筛查可能帮助确定父母是否是囊性纤维化试致癌基因突变的携带者,并对新生儿和儿童进行诊断测试。xTAG囊性纤维化39检测试剂盒能够检测39CF引起的基因突变,包括23CF跨膜电导调节器(CFTR)基因突变和4个变种(多态性),以及从人的血液样本发现16个额外的CFTR基因突变。该xTAG测试盒非常灵活,可以为医生提供可选择的突变的CFTR基因,他们想测试,直至整个39CFTR基因突变。这种灵活性是为了让实验室避免在各种不同的平台上进行测试,从而节省了时间和资源。此外-类似第一代xTAG测试盒(V1),新xTAG囊性纤维化39套v2并不需要反复的检测,所有结果可在每次运行中揭示和分析。用于测试的方案已被精简,使这一检测速度更快,更易于使用。xTAG囊性纤维化39(2版)是的产品,并已获得美国食品和药物管理局(FDA)准入。CF是一种遗传性外分泌腺疾病,主要影响胃肠道和呼吸系统,通常具有慢性梗阻性肺部病变,胰腺外分泌功能不足和汗液电解质异常升高的特征.(生物谷Bioon.com)相关新闻

CHEST中文版 胸科医学的新视野

显示文章共2篇2009年7月第6卷第4期囊性肺纤维化气道假单胞菌感染吸入氨曲南赖氨酸治疗的有效性及安全性我们评价囊性纤维化(CF)和铜绿假单胞菌(PA)气道感染患者短期雾化吸入氨曲南赖氨酸(AZLI,雾化用单胺菌素类抗生素)的有效性和安全性。在本项随机、双盲、安慰剂对照的跨国合作研究中(自2005年6月至2007年4月,AIR-CF1试验),164例患者(≥6岁)25%≤FEV1占预计值百分比≤75%,近期未使用抗假单孢菌抗生素或阿奇霉素,予75mgAZLI(每天3次,连续给药28d)或安慰剂(1:1随机给药),给药完成后监测14d...卢旺达囊性纤维化样症状患者的基因分析――验证异常囊性纤维化跨膜通道调节因子和上皮钠通道基因变异囊性纤维化(CF)患者存在氯和钠通道缺损,是CF跨膜传导调节蛋白(CFTR)功能丧失和CFTR与上皮钠通道(ENaC)异常交互作用的结果。少数患者表现为CF样症状、单个CFTR突变以及ENaC突变。我们收集60例具有CF表型非洲患者的临床数据和DNA样本,研究具有CF样症状的非洲患者以及疾病与CFTR和ENaC基因突变的关联。首先通过高效液相色谱法分析所有患者的CFTR基因,之后直接测序,而对仅携带单个CF变异的5例患者,通过序列测定分析ENaC基因的非电压门控钠通道1a(SCNN1A)、非电压门控钠通道1b(SCNN1B)...

囊性纤维化是由什么原因引起[de]?

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囊性纤维化病(cystic fibrosis,CF)是白种人中最常见的致死性常染色体隐性遗传病。由于大量粘液阻塞全身外分泌腺所致慢性阻塞性肺疾病和胰腺功能不全,CF临床主要表现为慢性咳嗽、大量粘痰及反复发作的难治性肺部感染、长期慢性腹泻、吸收不良综合征、生长发育迟缓等;汗腺受累表现为汗液中氯、钠离子异常增高。这种增高是临床诊断的最重要的特异性指标。1989年,Rommens等运用定位克隆(positional cloning)法将CF致病基因克隆出来。现已知CF基因位于人类染色体7q31,全长250kb,共有27个外显子,cDNA全长为6 129bp,基因编码为1 480个氨基酸的多肽链,这一蛋白质被命名为囊性纤维病跨膜转运调节物ystic fibrosis transmembrane conductance regulator,CFTR)。根据cDNA顺序推测,CFTR结构与生物界普遍存在的一类转运蛋白相似,它含有两个重复的由跨膜区和ATP结合折叠区(nucleotide ATP-Binding Folds,NBFs)组成的基因序列和一个调节区。实验证明CFTR为一氯离子通道蛋白,因基因突变导致CFTR蛋白的缺陷必将影响外分泌腺导管上皮细胞膜对氯离子的通透性减低,从而导致发病。在相当一部分白种人群中CF发病率高达1/2 000,而我国CF的发病率尚属未知,亦未进行过较系统的筛查。近年来已有少数CF病例报道,但均未经遗传分析证实。因此,在我国大陆至今仍无有关CF基因突变的报道。不久前在台湾发现2例CF患者第12外显子与内含子之间剪接位点的突变。我们在建立汗液钠离子检查法和较系统地筛查近300名正常和可疑患病儿童(另文报道),并追踪我国已有CF病例的基础上,用多聚酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)方法分析了2例经尸检诊断为CF患者的石蜡包埋组织DNA和3例反复上呼吸道感染,汗液Na+偏高患儿的外周血DNA标本,检查了其可能存在的突变位点,以了解中国人基因组DNA的CFTR基因结构及其突变类型和特点。1 材料与方法1.1 研究对象及标本来源 病例1、2为浙江医科大学病理教研室经尸检诊断为CF的病例,其供基因分析的DNA来自石蜡包埋组织。例3、4、5为因反复咳嗽,上呼道感染伴支气管肺炎,发育迟缓来华西医科大学附属医院就诊的患儿。经汗液检查其汗液钠接近正常值上限,基因检查用其外周静脉血提取DNA,有关临床和汗液检查资料见表1。表1 3例疑诊CF患儿身高、体重及汗液钠浓度例  号性  别年  龄(岁)身  高(cm)体  重(kg)汗液Na+浓度(mmol/L)1次2次3次4次3女5 98 15.5 55 58 54 53 4男10 124 23 62 61 60 61 5男12 130 27 60 61 63 60 1.2 寡核苷酸引物 用于CF基因DNA序列PCR-SSCP分析引物由加拿大多伦多大学儿童医院Lap-Chee Tsui教授和Zielenski博士惠赠。鉴于已知的CF突变在CFTR基因中的分布是非随机的,绝大多数集中于编码CFTR蛋白NBFs区的外显子9、10、11、12、19、20、21、22,跨膜区的外显子3、4、7、14a、14b、17b以及R区的第13外显子,故突变分析首先从这些外显子着手。所采用的28对PCR引物覆盖了易发生突变的21个外显子及相邻接部分内含子。所用引物碱基序列及其正常扩增产物长度见表2。表2 CFTR基因PCR┐SSCP突变分析用引物碱基序列及扩增产物长度外显子引  物  碱  基  序  列产物长度2 5′-GTGAATATCTGTTCCTCCTC-3′(2i-5s)5′-AGCCACCATACTTGGCTCCT-3′(2i-3s)268 3 5′-TGCAACTTATTGGTCCCACT-3′(3i-5s)5′-ATGAATGTACAAATGAGATCCT-3′(3i-3s)178 4 5′-TGTGTTGAAATTCTCAGGGT-3′(4i-5s)5′-ATGGGGCCTGTGCAAGGAAG-3′(4i-3s)314 5 5′-CCTGAGAAGATAGTAAGCTA-3′(5i-5s)5′-AACTCCGCCTTTCCAGTTGT-3′(5i-3)315 6a 5′-GGAAGATACAATGACACCTG-3′(6ai-5s)5′-CTGGTTTTACTAAAGTGGGC-3′(6ai-3s)271 7A 5′-AGACCATGCTCAGATCCTTCCA-3′(7i-5)5′-TAGTGCATAGGGAAGCACAG-3′(7i-3s)200 7B 5′-ACTTCAATAGCTCAGCCTTC-3′(7i-5s)5′-GCAAAGTTCATTAGAACTGATC-3′(7i-3s)281 8 5′-AATGCATTAATGCTATTCTG-3′(8i-5s)5′-TCGGCATTAGGATGAAATCC-3′(8i-3s)231 9 5′-ACAGGGATTTGGGGAATTAT-3′(9i-5s)5′-AAGAGACATGGACACCAAAT-3′(9i-3s)304 10 5′-TTGGAGGCAAGTGAATCCTG-3′(10i-5s)5′-AGTGTGAAGGGTTCATATCG-3′10i-3s)301 11 5′-TGAGCATACTAAAAGTGACTC-3′(11i-5s)5′-CAGCAAATGCTTGCTAGACC-3′(11i-3s)178 12 5′-GTGAATCGATGTGGTGACCA-3′(12i-5)5′-CTGGTTTAGCATGAGGCGGT-3′(12i-3)426 5′-TCTACACTAGATGACCAGGA-3′(12i-5s)5′-CTATGATGGGACAGTCTGTC-3′(12i-3)220 13A 5′-TGCTAAAATACGAGACATATTGC-3′(13i-5)5′-TGGTCGAAAGAATCACATCC-3′(13i-3sA)260 13B 5′-TCCAAAATCTACAGCCAGAC-3′(13i-5sA)5′-AGGGAGTCTTTTGCACAATG-3′(13i-3sB)258 13C 5′-TCAATCCAATCAACTCTATCAGAA-3′(X13B-5)5′-TTTCGGTGATCAACTCTATACGAA-3′(13i-3sC)253 13D 5′-GAACCTGATGACACACTCAG-3′(13i-5sB)5′-TACACCTTATCCTAATCCTATGAT-3′(13i-3A)292 14a 5′-TGGCATGAAACTGTACTGTC-3′(14ai-5s)5′-ATACAAACATAGTGGATTAC-3′(14ai-3)248 14b 5′-GAACACCTAGTACAGCTACT-3′(14bi-5)5′-ATACAAACATAGTGGATTAC-3′(14bi-3s)288 15A 5′-GTGCATGCTCTTCTAATGCA-3′(15i-5)5′-AGCAAAGTGTCGGCTACTCC-3′(15i-3s)247 15B 5′-GTGATTATCACCAGCACCAG-3′(15i-5s)5′-AAGGCACATGCCTGTGTGCA-3′(15i-3)306 17b 5′-TTCAAAGAATGGCAACAGTGT-3′(17bi-5)5′-TGTGGAACAGAGTTTCAAAG-3′(17bi-3s)254 19A 5′-TGTGAAATTGTCTGCCATTC-3′(19i-5sA)5′-CTGAGGGCCAGATGTCATCT-3′(19i-3s)204 19B 5′-GCCAACTCTCGAAAGTTATG-3′(19i-5s)5′-GCTAACACATTGCTTCAGGCT-3′(19i-3s)241 20 5′-GTCACGAGAAGTATCCCATC-3′(20i-5s)5′-CTGGTCAAGTCTTTTGACTC-3′(20i-3s)213 21 5′-GGTAAGTACAGGGTGTTTTC-3′(21i-5s)5′-GATGTCAGCATATCCAGCCA-3′(21i-3s)292 22 5′-GAATGTCAACTGCTTGAGTG-3′(221-5s)5′-TGTCACCATGAAGCAGGCAT-3′(22i-3s)386 23 5′-GTAAATACAGATCATTACTG-3′(23i-5s)5′-ATTACAAGGGCAATGAGATC-3′(23i-3s)289 1.3 DNA模板的提取1.3.1 外周血DNA提取 参考常规及本室先前使用方法。1.3.2 石蜡包埋组织DNA的提取 取4~5片厚约5~10μm的石蜡切片置1.5ml灭菌Eppendorf离心管中,加入0.5~1.0ml二甲苯后混匀,置室温20分钟,离心10分钟,弃上清液。重复上述二甲苯脱蜡1次,弃上清液后再加入无水乙醇液1.0ml,离心洗涤10分钟2次。真空干燥沉淀物,再加入消化缓冲液50~100μ和蛋白酶K(100mg/ml)1~2μl,置37℃过夜或55℃3小时。当管内组织完全消化后置94℃热变性10分钟,-20℃保存备用。1.4 PCR及PCR-SSCP分析1.4.1 PCR操作步骤 参考本室常规方法。PCR反应体积为10μl,加α-32 P-dCTP[111TBq/mmol,370GBq/ml(>3 000 Ci/mmol,10 Ci/ml)]0.08μl/29.6kBq(0.8μCi)标记产物。各反应镁离子浓度及循环参数见表3。在扩增第2外显子时为摸索最佳扩增条件曾先后采用过55℃、58℃、62℃和64℃4种退火温度。表3 PCR循环反应中镁离子浓度及温度引物号MgCl 2浓度(mmol/L)循环参数(秒/℃)变性退火延伸最后延伸(分/℃)2、4、9、10、13C1.5 45/94 45/55 90/72 10/72 13D、19A、19B 5、8、7A、7B、11 1.75 45/94 45/55 90/72 10/72 12 14a、14b、15B、2 1.5 45/94 45/58 90/72 10/72引物号MgCl 2浓度(mmol/L)循环参数(秒/℃)变性退火延伸最后延伸(分/℃)6a、20、21、23  1.75 45/94 45/58 90/72 10/72 13B、15A、17b 1.5 45/94 45/60 90/72 10/72 13A、2 1.5 45/94 45/62 90/72 10/72 3、22 1.75 30/94 30/62 60/72 8/72 2、1.5 45/94 45/64 90/72 10/72 1.4.2 SSCP凝胶电泳 取PCR扩增产物2.0μl,加入甲酰胺变性示踪液9.0μl,94℃变性10分钟后,立即置冰浴中,直至上样电泳。电泳时取上液3.0μl点样于厚0.4mm,含10%甘油的6%聚丙烯酰胺凝胶,然后在DNA测序仪上400~600V室温电泳12~16小时。电泳完毕将凝胶转移至普通滤纸上,不经干燥直接在-70℃中放射自显影24~72小时。2 结 果用28对引物扩增了上述5例CFTR基因的21个外显子,发现例1第2外显子扩增产物在SSCP凝胶上两条单链及双链带的迁移率均较正常人为快(图1),提示此例第2外显子存在碱基对的缺失或突变。根据患者与正常人第2外显子非变性扩增产物聚丙烯酰胺凝胶电泳结果比较,估计缺失约为30个碱基对(图2)。为验证5个病例有无与台湾患者相同的突变,我们在扩增12外显子区域时采用了两对巢式引物(见表2)。图4 CFRT基因第12外显子及邻接部分内含子区域示意←3′5′3′intron 12exon 12intron 115′→在用外侧引物扩增时发现例5两单链迁移率改变(图3),内侧扩增产物则无改变。图4为CFTR基因第12外显子及部分内含子区域示意图,图中粗箭头为外侧引物位置,细箭头为内侧引物位置,星号处为台湾患者碱基置换位置,由图可见内侧引物扩增产物已包含了台湾患者的突变位点,提示本例患者的变异位点与台湾患者不同,显示可能位于第12外显子两侧的内含子中。3 讨 论CF患者在某些地区及种族少见,在东方人中尤为罕见。但近年来在日本、巴基斯坦、台湾及旅美华人中也发现了少数CF患者。在台湾发现的两例患者中有白种人中罕见的1898+5G→T突变。迄今在我国大陆文献中共报道了11例已死亡的CF病例,其中4例曾经尸检确诊,5例为非标准的汗液检查方法诊断,而另2例则仅凭临床表现及家族史诊断。所有这些病例均未经基因分析确证,故至今我国大陆仍无有关CF致病基因突变的报道。本实验运用PCR-SSCR方法,检查了2例经尸检确诊为CF的石蜡包埋组织NDA以及有CF临床表现、汗液钠离子浓度在正常上限的3例患儿外周血DNA。我们共使用了28对引物,检查了包括第3、4、5、6a、7、8、9、10、11、12、13、14a、14b、15、17b、19、20、21、22、23和第2外显子在内的21个外显子及其相邻剪接位点附近的内含子部分DNA序列,共约为7 503bp。通过PCR-SSCP分析,我们发现例1在第2外显子区域有缺失存在,这是用DNA分析方法证实的我国大陆首例CF病例。根据CF遗传分析协会公布的资料,仅为数不多的几例患者在CFTR基因第2外显子发现过突变。后者多发生在外显子起始端,包括错义突变,无义突变和移码突变,发现如此大段DNA缺失则未见报道。CF病例在华人中十分罕见,迄今台湾发现的患者中(内部通讯)有2例突变均在第12内含子中,距12外显子和内含子的剪接位点下游第5个碱基处,性质为G→T置换,即1898+5G→T。本实验使用了两对巢式引物检测5个病例DNA标本的第12外显子和包括台湾患者突变位点在内的12内含子的一部分。发现例5在用外侧引物扩增的产物两条单链电泳迁移率的改变,但内侧引物扩增产物则无改变。由于内侧引物扩增产物已包含了台湾患者突变位点,故本例变异位点可能与台湾患者不同。但此变异的确切位点,尚需DNA测序鉴定,对该变异的性质和临床意义也需通过研究其对基因转录功能的影响方能确定。我国CF研究尚处于起步阶段。今后似应在向广大临床医师普及CF的临床诊断要点,并建立和推广标准化的汗液Cl-和Na+检测方法和基因诊断方法。同时通过对我国人群中CFTR基因突变的调查,获得有关我国CF发病的较确切可信的资料。此调查结果与白种人群发病情况的比较,将有助于了解中国人CFTR基因区域DNA结构的特点,并为不同民族基因组的研究作出贡献。(本文图1~3见原刊)(原载《中华医学遗传学杂志》1995年第1期)

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